Alfarnate se encuentra rodeado por las sierras de Enmedio, Palomera y Jobo y su centro urbano está a 888 m sobre el nivel del mar (alcanzando los 925 m en la ermita de Monsalud); característica que no se refleja en sus calles que son llanas y solo se estrechan en determinados puntos de la población. Ocupa una extensión de 34,0661 km² y pertenece al Corredor de Málaga, conocido anteriormente como Campo de Cámara, junto a Casabermeja, Colmenar, Riogordo, Alfarnatejo y Comares. Tradicionalmente, Alfarnate ha mantenido la mayoría de contactos por carretera con Málaga y Granada. Está supeditado al partido judicial de Málaga y al arciprestazgo de Archidona-Campillos y según datos oficiales del padrón municipal cuenta con una población de 1039 habitantes (2022).
El nombre del pueblo parece provenir de la palabra árabe Al-farnat, que significa ‘molino de harina’. Aparece documentada la referencia en el siglo x como zona de fuerte producción de harina en los escritos del cronista del siglo x Ahmad al-Razi, donde se recoge la importancia del cultivo de trigo en aquella época y los susodichos molinos harineros.10 En el pueblo vecino de Alfarnatejo todavía se pueden contemplar dos molinos harineros que funcionaban con el agua del arroyo (en siglos anteriores de mucho caudal) y que dan una idea de lo que era esta zona en aquellos tiempos.
El término municipal de Alfarnate se encuentra al noreste de la provincia de Málaga correspondiendo a la comarca de la Axarquía. Sus límites lindan con Granada y Málaga, situándose en una posición privilegiada al encontrarse prácticamente a una hora de distancia, 84 km y 54 km de cada uno.
